多肽合成

采用逐步縮合定向法以得到具有特定氨基酸順序的多肽，把不需要反應的氨基羧基用基團保護起來，再進行連接反應，保證定向反應的順利進行。

液相法和固相法是多肽合成的主要方法。固相法具有可自動化操作，產物易分離的優勢而被更加廣泛地使用。分為Fmoc和tBoc法，由于前者具有更大優勢，故如今多采用Fmoc法合成。

基本流程：

1.      去保護：Fmoc保護的柱子和單體必須用一種堿性溶劑（piperidine）去除氨基的保護基團。

2.      激活和交聯：下一個氨基酸的羧基被一種活化劑所活化。活化的單體與游離的氨基反應交聯，形成肽鍵。在此步驟使用大量的超濃度試劑驅使反應完成。循環：這兩步反應反復循環直到合成完成。

3.      洗脫和脫保護：多肽從柱上洗脫下來，其保護基團被一種脫保護劑（TFA）洗脫和脫保護。

多肽的修飾

多肽修飾是改變肽鏈主鏈結構和側鏈基團的重要手段。多肽修飾的方法主要分為液相法和固相法。常見的多肽修飾是乙酰化，烷基化，生物素修飾，磷酸化或磺酸化等。具體修飾原理以組蛋白的乙酰化為例：

組蛋白中賴氨酸的N端殘基可發生乙酰化，且可逆。在乙酰基轉移酶的作用下，在賴氨酸的N短引入乙酰基。

多肽的耦聯

多肽的偶聯有三種方式：偶聯在多肽的N端的氨基酸上；偶聯在多肽的C端氨基酸上；偶聯在多肽序列中的半胱氨酸上。

用于與多肽耦聯的載體蛋白有多種，其中常用的是keyhole limpethemacyanin (KLH),牛血清白蛋白（bovineserumalbumin，BSA）,卵清蛋白（ovalbumin，OVA）和牛甲狀腺球蛋白（bovine thyroglobulin，THY)。KLH具有更高的抗原性，是常用的多肽耦聯載體。

EDC(1-ethyl-3-(3-dimethylaminopropyl)carbodiimidehydrochloride)或carbodiimide方法是將多肽和載體耦聯的常用方法。Carbodiimides能激活天冬酰胺酸及谷氨酸的側鏈羧基集團及末端羧基集團，使之與主胺基發生耦聯反應。激活的多肽與載體蛋白混合而產生終的共軛體。如果載體蛋白先被激活，EDC方法則通過N－末端alpha－氨基，或者，如果序列中有賴氨酸的話，則可以通過賴氨酸的側鏈氨基與載體蛋白耦聯。